Wednesday, May 13, 2009

第一篇文章被接受了

嗯啊,文章<>终于被接受了,凌老师已经把版面费交上了,估计这事就算成了~写写博客纪念一下这段历程。
好吧,文章能发出乎我的意料,我个人是不太看好的。记得还是研一的刚开学的九月份吧,苏老师找我谈话,大体意思是看我最近很闲,给我布置个课题,就造个杨树的泛素数据库,说要是速度快,也许能发个小文章,作为毕业论文的一部分。当时刚开始接触生物信息,是两眼一抓瞎,老板说干啥就干啥喽,心中也小希翼一下,心想这就有能发文章的课题了。也没有想到这一作就是一年半,期间断断续续,波折不断。
嗯,老板布置课题的时候就几句话,现在还在我记录本上呢,我看了看大抵就是一句话:做个数据库,杨树的,关于泛素的。之后我就开工了~最开始的情况我现在记忆还是很清楚的,概括的说就是啥也不懂,啥也不会,多亏有ll同学的一个拟南芥泛素数据作为模本,我模仿着来做。但是跟拟南芥有现成的数据不一样,杨树可没有,所以问题还是很大的。于是请教各位师兄,也发现了还是XZ靠谱,无所不知啊,生物信息工具熟得很。
好吧就这么做吧,迷迷糊糊一边啃各种书,一边瞎做。影响很深地是两点,一是我计算机基础实在不敢恭维,需要用到的技术全是零起点,这令我很自卑啊~非常羡慕学计算机出生的,也一度非常彷徨啊~二是我对泛素降解这个系统也是很陌生的,嗯,然后疯狂地读paper,跟这个系统相关的文章我分门别类的收集了100多篇,大部分就是看了看摘要粗略地瞅了瞅,有一些是精读了。当时看得也挺辛苦的,熬夜来看,搞得黑白颠倒,生物种混乱。我想客观地说看这些文献对于展开思路还是很有帮助的,后来文章中的一些工作和方法都是从文章中学来的。结果在研一的第一个学期,数据库就大概做好了。寒假回家写初稿,嗯,记得当年冬天大雪灾啊,暴冷,打字都不愿打了,呵呵。后来假期回来,有做了点就把这个杨树的数据库---DPUPS给投出去了,投在BMC bioinformatics,编辑把文章转到了BMC genomics。等待期间我就跟着老周做easygo去了。
我个人是对DPUPS不抱希望的,等七月份在家过暑假,review意见回来了,跟我预期的一样,被拒掉了~两个review都是大幅的否定,其中一个说得贼难听了~呵呵,虽然意见中肯吧,但是第一次被人批,心里还是不是滋味啊。我不由想起了老周给我看过的BLAST作者一次报告的PPT中的一幅照片:就是该猛人把BLAST投到某某杂志,结果被人猛K一顿的据信,照片该据信皱巴巴的充分反映出了作者当时心中的愤怒,当然现在人家牛逼了,BLAST牛逼了,所以也算是个讽刺吧。嗯,好吧,扯这个就是说明我也想将来能有这么一天能如此拉风就好,说白了,就是可以装逼~哥也如此这般:底下是万千崇拜者,哥PPT贴上一封别人言辞激烈的据信,然后拽拽地来句:走在科研前段的男人总是为一般人所不理解。这个逼可装大发了~想想都快意啊~好吧,事实是人家没有给我据信,只是一封破email,更加可怕地是人家说得是事实,我没有像之前猛人那样咸鱼翻身的机会。
review给的意见很笼统,所以我也一度想放弃算了,做别的喽,也没指望过这么早发文章。后来一琢磨,干脆一不做二不休,就多整几个物种得了,整个plantsUPS得了。老板也同意。之后就磨磨唧唧磨磨唧唧地干着,期间也怀疑过,但是想着反正就这么最后一折腾也就做下来了。嗯,终于在今年三月份投出去了,算是松了口气。也没多想,心说要是意见回来了,能给改则改,如果又是一通猛批,哼哼,来句狠得,爷不伺候了,不做了~
嗯,等到四月30号一天晚上,忽然收到了老板的邮件,说是好消息,看看了意见,居然出奇地好,只说是语言上需要修改修改,其他都OK。这个完全出乎我的意料啊。然后找公司改了改文章,这周二来信,说是就这么接受了~
好吧,总算是有点小成了~没有发之前,我老跟别人说,无论大小赶紧先整上一篇,所谓手中有文章,心中就不慌。现在手里算是有了一篇了,但是我依然很慌啊~Database的文章科研价值不大,扛不住事啊~手里头的话一大堆的。感觉发了就发了,生活没有什么改变,就跟以前贼想要个笔记本一样,有了笔记本的杜舟就是有笔记本的杜舟。嗯,发了篇小文章的杜舟就是有篇文章的杜舟,日子跟以前差不多,唉,我还在挣扎中~
啰嗦半天,感觉自己不知所云,没什么,谨以此文纪念一下为科研献身的一年半时光,文章没啥可关注的,做文章的日子,才是我想回忆的~

2 comments:

Xin said...

这已经是个很不错的成果了,继续好好干吧。

Xin said...

貌似国内又可以访问blogger了鸟,俺来拍个爪印儿试试杜某能看见不